A fisioterapia na ANDEF funciona desde 1993, com objetivo de atuação na prevenção, cura e reintegração do indivíduo portador de deficiência física à sociedade. O trabalho de reintegração é fortalecido através da adaptação e incentivo ao esporte adaptado, oferecido pela associação. Com a ampliação do setor de fisioterapia, uma nova clientela se fez presente, com atendimentos oferecidos a crianças, através do setor pediátrico, e a comunidade, através do próprio setor de ginásio geral e hidroterapia.

A fisioterapia faz parte de uma equipe interdisciplinar, composta por: médico neurologista e psiquiatra, psicologia, nutrição, serviço social, terapia ocupacional e fonoudiologia, realizando atendimentos as pessoas com lesões neurológicas, ortopédicas, reumatológicas, posturais definitivas ou temporárias, além da atenção a saúde da comunidade, que apresenta alterações relacionadas a diabetes, hipertensão, obesidade e alterações posturais.

Por ser uma associação voltada para as pessoas portadoras de deficiência física, a atuação da fisioterapia no esporte adaptado é um dos principais focos do trabalho desenvolvido no setor, proporcionando a condição de reabilitação no seu contexto de resgate do físico e psico-social. O esporte adaptado complementa a atuação fisioterapêutica, através dos benefícios no processo de reabilitação. Gera ao paciente-atleta o convívio com sua deficiência, consciência de limitações e potenciais, desenvolvimento da auto-estima, incentivo à busca de independência e integração social.